استخدام مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا (RAPD) لتحليل التباين الوراثي لانواع من الفطر Alternaria

لقد جرى استخدام تقنية RAPD المعتمدة على تفاعل PCR لايجاد البصمة الوراثية والعلاقة الوراثية بين تسعة انواع من الفطر Alternaria المعزولة من نباتات محاصيل مختلفة مصابة بمرض تبقع الاوراق في مدينة الموصل / العراق. وجرى استخلاص الدنا من كل نوع وبتركيز نهائي قدره 400-300 مايكروغرام لكل 3-2غرامات من الغزل الفطري الرطب وبنقاوة 1.8-1.6. وجرت مضاعفة كل عينة من عينات الدنا بواسطة 22 بادئا وفرزت النتائج بالترحيل كهربائيا خلال هلام الاكاروز ذي التركيز 1.2% والمصبغ بالمادة المتألقة بروميد الايثيديوم والتصوير تحت اشعة الــUV. وفيما اخفق احد البوادئ في دعم عملية التضاعف لاي دنا مجيني فقد افلح 21 بادئا اخر في ذلك وانتجت ما مجموعه 112 حزمة دنا ( بمعدل 10-2لكل بادئ) عبر الانواع الفطرية التسعة وكان 100 حزمة من هذه الحزم متباينا ( بمعدل 10-1 لكل بادئ ) وكان اقل البوادئ كفاءة في اسناد التضاعف هو البادئ OP-H01 (بكفاءة 1.79%)، و أكثرها كفاءة (10%) وهو البادئ OP-M05، إذ استطاع ان يميز جميع الانواع التسعة وذلك من خلال الانماط الفريدة من التحزيم في كل نوع. لقد استطاعت تقنية RAPD كذلك تحديد البصمة الوراثية لثمانية انواع من الانواع التسعة المدروسة وذلك من خلال ظهور حزم مؤشرة فريدة حين مضاعفة الدنا من كل نوع من هذه الانواع مع واحد او اكثر من البوادئ الواحد والعشرين أعلاه. كما أن التحليل العنقودي للمسافات الوراثية بين هذه الانواع التسعة قد وضع الانواع في ثلاث مجموعات رئيسة دون ملاحظة وجود علاقة بين توزيع الانواع على هذه العناقيد الثلاثة وتوزيعها على المضائف التي جمعت منها.